Wenn man unter Windows mit dem ssh.com-Client ein SSH-Schlüsselpaar erzeugt und dieses dann auch unter Linux benutzen will, reicht es nicht, einfach die Dateien nach ~/.ssh/ zu kopieren, da Linux ein anderes Format des Schlüssels erwartet.
Zum Konvertieren kann man aber einfach den PUTTYgen aus dem Putty-Paket nehmen (welches es für Windows und Linux gibt).